يتم القبول والتوزيع لتخصصات الكلية اعتباراً من الفرقة الأولى وفقاً للائحة الإدارة العامة للقبول والتسجيل وتقويم وتوثيق الشهادات الصادرة عن وزارة التعليم العالي والبحث العلمي، وشروط القبول الداخلية لجامعة القرآن الكريم وتأصيل العلوم. ويتم تسجيل الطلاب بالكلية وفقاً للوائح ونظم أمانة الشؤون العلمية بجامعة القرآن الكريم وتأصيل العلوم.